Open WL Archief (OWA)

Over het archief

Het OWA, het open archief van het Waterbouwkundig Laboratorium heeft tot doel alle vrij toegankelijke onderzoeksresultaten van dit instituut in digitale vorm aan te bieden. Op die manier wil het de zichtbaarheid, verspreiding en gebruik van deze onderzoeksresultaten, alsook de wetenschappelijke communicatie maximaal bevorderen.

Dit archief wordt uitgebouwd en beheerd volgens de principes van de Open Access Movement, en het daaruit ontstane Open Archives Initiative.

Basisinformatie over ‘Open Access to scholarly information'.

[ meld een fout in dit record ]

mandje (1): toevoegen | toon

---

one publication added to basket [250402]

Flow cytometric enumeration of marine viral populations at low abundances Mojica, K.D.A.; Evans, C.; Brussaard, C.P.D. (2015). Flow cytometric enumeration of marine viral populations at low abundances, in: Mojica, K.D.A. Viral lysis of marine microbes in relation to vertical stratification. pp. 159-171 In: Mojica, K.D.A. (2015). Viral lysis of marine microbes in relation to vertical stratification. PhD Thesis. Universiteit van Amsterdam: Amsterdam. ISBN 978-94-91407-20-8. 247 pp. hdl.handle.net/11245/1.487499, meer Is gerelateerd aan: Mojica, K.D.A.; Evans, C.; Brussaard, C.P.D. (2014). Flow cytometric enumeration of marine viral populations at low abundances. Aquat. Microb. Ecol. 71(3): 203–209. http://dx.doi.org/10.3354/ame01672, meer

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ [ aanvragen ]

---

Author keywords

Flow cytometry; Low abundance; Virus enumeration

---

Auteurs		Top
Mojica, K.D.A., meer Evans, C., meer Brussaard, C.P.D., meer

---

Abstract

Flow cytometric enumeration has advanced our ability to analyze aquatic virus samples and thereby our understanding of the ecological role viruses play in the oceans. However, low virus abundances are underestimated using the current flow cytometry (FCM) protocol. Our results revealed that low dilutions (<30-fold) not only decreased the total virus count but also limited the ability to differentiate between virus clusters. Here we report a simple and efficient method optimization for improving virus counts and optical resolution at low abundances. Raising the pH of the Tris-EDTA (TE) buffer to 8.2 successfully countered the effect of insufficient buffering capacity at low dilutions, which is caused by the higher proportion of acidic glutaraldehyde fixative in the final sample. The higher buffer pH did not interfere with virus counts at higher dilutions. We therefore recommend amendment of the standard FCM aquatic virus enumeration protocol using a TE buffer with pH 8.2 as a simple and efficient improvement.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs

IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.