Over het archief
Het OWA, het open archief van het Waterbouwkundig Laboratorium heeft tot doel alle vrij toegankelijke onderzoeksresultaten van dit instituut in digitale vorm aan te bieden. Op die manier wil het de zichtbaarheid, verspreiding en gebruik van deze onderzoeksresultaten, alsook de wetenschappelijke communicatie maximaal bevorderen.
Dit archief wordt uitgebouwd en beheerd volgens de principes van de Open Access Movement, en het daaruit ontstane Open Archives Initiative.
Basisinformatie over ‘Open Access to scholarly information'.
A synthesis of bacterial and archaeal phenotypic trait data
Madin, J.S.; Nielsen, D.A.; Brbic, M.; Corkrey, R.; Danko, D.; Edwards, K.; Engqvist, M.K.M.; Fierer, N.; Geoghegan, J.L.; Gillings, M.; Kyrpides, N.C.; Litchman, E.; Mason, C.E.; Moore, L.; Nielsen, S.L.; Paulsen, I.T.; Price, N.D.; Reddy, T.B.K.; Richards, M.A.; Rocha, E.P.C.; Schmidt, T.M.; Shaaban, H.; Shukla, M.; Supek, F.; Tetu, S.G.; Vieira-Silva, S.; Wattam, A.R.; Westfall, D.A.; Westoby, M. (2020). A synthesis of bacterial and archaeal phenotypic trait data. Scientific Data 7(1): 170. https://hdl.handle.net/10.1038/s41597-020-0497-4
In: Scientific Data. Nature Publishing Group: London. ISSN 2052-4463; e-ISSN 2052-4463, meer
|   |
| Auteurs | | Top |
- Madin, J.S.
- Nielsen, D.A.
- Brbic, M.
- Corkrey, R.
- Danko, D.
- Edwards, K.
- Engqvist, M.K.M.
- Fierer, N.
- Geoghegan, J.L.
- Gillings, M.
|
- Kyrpides, N.C.
- Litchman, E.
- Mason, C.E.
- Moore, L.
- Nielsen, S.L.
- Paulsen, I.T.
- Price, N.D.
- Reddy, T.B.K.
- Richards, M.A.
- Rocha, E.P.C.
|
- Schmidt, T.M.
- Shaaban, H.
- Shukla, M.
- Supek, F.
- Tetu, S.G.
- Vieira-Silva, S., meer
- Wattam, A.R.
- Westfall, D.A.
- Westoby, M.
|
| Abstract |
A synthesis of phenotypic and quantitative genomic traits is provided for bacteria and archaea, in the form of a scripted, reproducible workflow that standardizes and merges 26 sources. The resulting unified dataset covers 14 phenotypic traits, 5 quantitative genomic traits, and 4 environmental characteristics for approximately 170,000 strain-level and 15,000 species-aggregated records. It spans all habitats including soils, marine and fresh waters and sediments, host-associated and thermal. Trait data can find use in clarifying major dimensions of ecological strategy variation across species. They can also be used in conjunction with species and abundance sampling to characterize trait mixtures in communities and responses of traits along environmental gradients. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
