Over het archief
Het OWA, het open archief van het Waterbouwkundig Laboratorium heeft tot doel alle vrij toegankelijke onderzoeksresultaten van dit instituut in digitale vorm aan te bieden. Op die manier wil het de zichtbaarheid, verspreiding en gebruik van deze onderzoeksresultaten, alsook de wetenschappelijke communicatie maximaal bevorderen.
Dit archief wordt uitgebouwd en beheerd volgens de principes van de Open Access Movement, en het daaruit ontstane Open Archives Initiative.
Basisinformatie over ‘Open Access to scholarly information'.
Draft genome sequences of three filamentous cyanobacteria isolated from brackish habitats
Boden, J.S.; Grego, M.; Bolhuis, H.; Sánchez-Baracaldo, P. (2021). Draft genome sequences of three filamentous cyanobacteria isolated from brackish habitats. Journal of Genomics 9: 20-25. https://doi.org/10.7150/jgen.53678
In: Journal of Genomics. Ivyspring International Publisher: Wyoming, NSW. e-ISSN 1839-9940, meer
|   |
| Trefwoorden |
Cyanobacteria [WoRMS]; Halomicronema Abed, Garcia-Pichel & Hernández-Mariné, 2002 [WoRMS]; Leptolyngbya Anagnostidis & Komárek, 1988 [WoRMS]; Spirulina Turpin ex Gomont, 1892 [WoRMS]
|
| Author keywords |
Spirulina sp. CCY15215; Halomicronema sp. CCY15110; Leptolyngbya sp. CCY15150; cyanobacteria; genome; brackish |
| Auteurs | | Top |
- Boden, J.S.
- Grego, M., meer
- Bolhuis, H., meer
- Sánchez-Baracaldo, P.
|
|
|
| Abstract |
Brackish cyanobacterial genome sequences are relatively rare. Here, we report the 5.5 Mbp, 5.8 Mbp and 6.1 Mbp draft genomes of Spirulina sp. CCY15215, Leptolyngbya sp. CCY15150 and Halomicronema sp. CCY15110 isolated from coastal microbial mats on the North Sea beach of the island of Schiermonnikoog in the Netherlands. Large scale phylogenomic analyses reveal that Spirulina sp. CCY15215 is a large celldiameter cyanobacterium, whereas Leptolyngbya sp. CCY15150 and Halomicronema sp. CCY15110 are the first reported brackish genomesbelonging to the LPP clade consisting primarily of Leptolyngbya, Plectonema and Phormidium spp. Further genome miningdivulges that all new draft genomes contain, ggpS and ggpP, the genes responsible for synthesising glucosylglycerol (GG), a compatible solute found in moderately salt-tolerant cyanobacteria.
|
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
